Esta comunicação se alicerça em uma experiência no Estado, com o intuito de descrever alguns impasses relacionados ao Subsistema de Atenção à Saúde Indígena (SASI) em âmbito regional. No Brasil, a política de saúde para os povos indígenas foi desenhada de maneira a privilegiar a organização espacial e cultural dos povos indígenas, visando a uma oferta de serviços culturalmente diferenciados. Além disso, com o modelo de gestão do SASI, procurou-se evitar que interesses locais, sobretudo os de cunho anti-indígena, pudessem comprometer a oferta de atenção à saúde para esta população. Dessa forma, apesar de ser parte do Sistema Único de Saúde (SUS), o SASI difere significativamente do SUS em termos das relações interfederativas que lhe são constitutivas. Esse ponto será abordado desde uma perspectiva localizada na esfera estadual. De uma posição de agente na gestão do SUS, apresentarei reflexões sobre os atravessamentos hegemônicos dados no campo da saúde pela ciência, em contraponto ao caráter participativo instituinte da política de saúde no Brasil, contextualizadas pela mediação da aplicação de recursos estaduais (RS) na atenção à saúde indígena.